Ο Γιάννης Καβαρατζής γεννήθηκε στο χωριό Λευκίμη Σουφλίου το 1940, έζησε στην Αλεξανδρούπολη και την Κομοτηνή και σπούδασε Ιατρική στο Πανεπιστήμιο Αθηνών.