Η εκκλησιαστική διαδρομή του Μητροπολίτη Παντελεήμονα δεν υπήρξε ανέφελη καθώς από το 2013 υπήρξαν δημοσιεύματα που τον ενέπλεκαν με πλαστογραφία και προσβολή δημοσίας αιδούς